Pewne gry w kolejnym etapie zmagań na centralnym szczeblu rozgrywek są też TKM Włocławek oraz KKS Pro-Basket Kutno, Po dwa zwycięstwa w grupie zanotowały jeszcze WKS Śląsk Wrocław i KK UR Kraków, ale nie mogą być jeszcze pewne gry w kolejnym etapie.
W turniejach ćwierćfinałowych nie biorą udziału WKK Wrocław, Trefl Sopot SA, KS Rosa Sport Radom i Biofarm Basket Junior Poznań, które zajęły pierwsze miejsca w czterech najwyżej sklasyfikowanych strefach i rywalizację rozpoczną od półfinałów.
W dniu 24 stycznia po wycofaniu drużyny MKS Ósemka Skierniewice, podjęła decyzję o przyznaniu „dzikiej karty” do rozgrywek U20M zespołowi MTS Basket Kwidzyn.
Grupa I - organizator KS Korona Kraków
Grupa II - organizator KSK Noteć Inowrocław
- Mistrzostwa Polski Mężczyzn U20
- 28.01.2017 12:00
MKK Pyra Poznań
Exact Systems Śląsk Wrocław
Grupa III - organizator ZKS Stal Stalowa Wola
Grupa IV - organizator MUKS BASKET AZS PW Warszawa
- Mistrzostwa Polski Mężczyzn U20
- 28.01.2017 14:00
MUKS Basket AZSPW Wawer Warszawa
MOSM Tychy
Grupa V - organizator Gama SKS Starogard Gdański
Grupa VI - organizator MKKS Żak Koszalin